
<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=big5"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div class="">Dear Chris,</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Many thanks for your comments.</div><div class="">I have test the installation of MPI package with some simple programs shown in this link: <a href="http://micro.stanford.edu/wiki/Install_FFTW3:" class="">http://micro.stanford.edu/wiki/Install_FFTW3:</a></div><div class="">Here are my tests:</div><div class="">+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++</div><div class=""><div class="">lupin@GLTCU:~$ mpic++ -I/use/include simple_mpi_example.c -L/usr/lib/x76_64-linux-gnu/ -lfftw3_mpi -lfftw3 -o simple_mpi_example</div><div class="">simple_mpi_example.c: In function ‘int main(int, char**)’:</div><div class="">simple_mpi_example.c:16:25: warning: format ‘%i’ expects argument of type ‘int’, but argument 2 has type ‘ptrdiff_t {aka long int}’ [-Wformat=]</div><div class="">  printf("%i\n", local_n0);</div><div class="">                         ^</div><div class="">lupin@GLTCU:~$ mpic++ -I/usr/include simple_example.c -L/usr/lib -lfftw3 -o simple_example</div><div class="">lupin@GLTCU:~$ ./simple_mpi_example</div><div class="">10000</div><div class="">finalize</div><div class="">lupin@GLTCU:~$ ./simple_example</div><div class="">power of original data is 32130.000000</div><div class="">power of transform is 32130.000000</div></div><div class="">++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++</div><div class="">It seems the MPI can be performed smoothly, so I do not think the problem was caused by MPI.</div><div class="">In addition, I did not receive any error message when I installed the DiFX.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Sincerely,</div><div class="">

<div class=""><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">--</span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">Lupin Chun-Che Lin</span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">Supporting Scientist of GLT (GreenLand Telescope) project </span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">in Institute of Astronomy and Astrophysics, Academia Sinica,</span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">14F of Astronomy-Mathematics Building (Rm: 1405), </span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">National Taiwan University. </span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">No.1, Sec. 4, Roosevelt Rd, Taipei 10617, Taiwan.</span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">Tel: +886-2-2366-5464</span></div><div style="font-family: 新細明體, sans-serif; font-size: 14px;" class=""><span style="font-size: 12px;" class="">Fax: +886-2-2367-7849</span></div></div><div class=""><br class=""></div><br class="Apple-interchange-newline">

</div>

<br class=""><div><blockquote type="cite" class=""><div class="">Chris Phillips <<a href="mailto:christo.phillips@gmail.com" class="">christo.phillips@gmail.com</a>> 於 2016年11月4日 下午8:35 寫道：</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class=""><div dir="ltr" class="">Hi Lupin,<div class=""><br class=""></div><div class="">I am not sure what the problem might be (sorry!). But from the look of it, I suspect this is a local setup problem, not a DIFX problem specifically. You might want to compile a MPI test program (google for a simple example) and see if you can get anything running).</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Regards</div><div class="">Chris</div><div class=""><br class=""></div></div><div class="gmail_extra"><br class=""><div class="gmail_quote">On Fri, Nov 4, 2016 at 7:03 PM, Lupin Lin <span dir="ltr" class=""><<a href="mailto:lupin@asiaa.sinica.edu.tw" target="_blank" class="">lupin@asiaa.sinica.edu.tw</a>></span> wrote:<br class=""><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word" class="">To whom will concern it,<div class=""><br class=""></div><div class="">When I finished the installation of DiFX in a new computer with the OS of Ubuntu 16.04, I tried to test for correlation using the command “startdifx”.</div><div class="">However, I receive the following error messages.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">lupin@GLTCU:/data2/lupin/g3-<wbr class="">7033$ startdifx -n -f g3_7033.input</div><div class="">------------------------------<wbr class="">------------------------------<wbr class="">--------------</div><div class="">While computing bindings, we found no available cpus on</div><div class="">the following node:</div><div class=""><br class=""></div><div class="">  Node:  GLTCU</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Please check your allocation.</div><div class="">——————————————————————————————<wbr class="">——————— </div><div class=""><br class=""></div><div class="">Here’s the contents of g3_7033.machines,</div><div class=""><div class="">GLTCU</div><div class="">GLTCU</div><div class="">GLTCU</div><div class="">GLTCU</div><div class="">GLTCU</div></div><div class=""><br class=""></div><div class="">And here’s the contents of g3_7033.threads,</div><div class=""><div class="">NUMBER OF CORES:    1</div><div class="">4</div></div><div class=""><br class=""></div><div class="">GLTCU has one CPU of 4 cores, and I have checked the /etc/hosts.</div><div class="">————————</div><div class=""><div class="">127.0.0.1       localhost</div><div class="">127.0.1.1       GLTCU</div><div class="">127.0.0.1 localhost.localdomain localhost</div><div class="">127.0.1.1 GLTCU.localdomain     GLTCU</div></div><div class="">————————</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Therefore, I have no opinion why the computing server cannot find CPUs.</div><div class="">Did anyone meet the similar problem? </div><div class=""><br class=""></div><div class="">Sincerely,</div><div class="">

<div class=""><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">--</span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">Lupin Chun-Che Lin</span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">Supporting Scientist of GLT (GreenLand Telescope) project </span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">in Institute of Astronomy and Astrophysics, Academia Sinica,</span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">14F of Astronomy-Mathematics Building (Rm: 1405), </span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">National Taiwan University. </span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">No.1, Sec. 4, Roosevelt Rd, Taipei 10617, Taiwan.</span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">Tel: <a href="tel:%2B886-2-2366-5464" value="+886223665464" target="_blank" class="">+886-2-2366-5464</a></span></div><div style="font-family:新細明體,sans-serif;font-size:14px" class=""><span style="font-size:12px" class="">Fax: <a href="tel:%2B886-2-2367-7849" value="+886223677849" target="_blank" class="">+886-2-2367-7849</a></span></div></div><div class=""><br class=""></div><br class="m_-7502959320639769903Apple-interchange-newline">

</div>

<br class=""></div><br class="">______________________________<wbr class="">_________________<br class="">

Difx-users mailing list<br class="">

<a href="mailto:Difx-users@listmgr.nrao.edu" class="">Difx-users@listmgr.nrao.edu</a><br class="">

<a href="https://listmgr.nrao.edu/mailman/listinfo/difx-users" rel="noreferrer" target="_blank" class="">https://listmgr.nrao.edu/<wbr class="">mailman/listinfo/difx-users</a><br class="">

<br class=""></blockquote></div><br class=""></div>

_______________________________________________<br class="">Difx-users mailing list<br class=""><a href="mailto:Difx-users@listmgr.nrao.edu" class="">Difx-users@listmgr.nrao.edu</a><br class="">https://listmgr.nrao.edu/mailman/listinfo/difx-users<br class=""></div></blockquote></div><br class=""></body></html>